Bakterie- DNA, sekvensering (16S)

16S DNA sekvensering bakterier, 16S rRNA

E-remiss i Cosmic i första hand. Reservrutin Remiss 5.

Utöver information om provmaterial och lokalisation ska även kortfattad klinisk information anges på remissen. Vid misstanke om Whipples sjukdom (Tropheryma whipplei) måste detta anges i remissen. Provet skickas då alltid till Karolinska universitetslaboratoriet.

Använd sterilt plastör (gul kork), Varuförsörjningens artikelnummer 80862, https://varuforsorjningen.se/produkter/laboratorie-och-diagnostik/laboratoriematerial-allmant/ror-proppar-och-flrvaringsbox/ror-pp-konisk-16x100mm-10ml-grad-m-skruvlock-o-skrivfalt-80862?variant=80862 För analys av punktat (CSV, pleura, ledvätska etc.), skicka minst 0,5ml. Om aktuellt provmaterial inte finns beställningsbart i Cosmic (t.ex. abscesspunktat), välj ”Övrigt provmaterial” och ange vilket provmaterial som avses.

Sänd provet med nästa ordinarie transport.

Mikrobiologilaboratoriet Västerås

Prov skickas till Akademiska laboratoriet, Uppsala eller Karolinska universitetslaboratoriet, Stockholm beroende på provmaterial. Akademiska laboratoriet: Vävnadsprover, ledvätska, pleuravätska, abscesspunktat, kärlgraft. Karolinska universitetslaboratoriet: Cerebrospinalvätska, övriga punktat, övriga främmande material. Om Svamp-DNA (ITS) sekvensering beställts vid samma tillfälle skickas prov till Karolinska universitetslaboratoriet oavsett material. Information om analyserande laboratorium anges i svaret.

Kylförvaras i väntan på transport. Om allmän odling beställts samtidigt från samma provlokal kommer prov för 16S kylförvaras i avvaktan på preliminärt odlingssvar. Vid negativ odling efter två dygn skickas provet för 16S. Vid positiv odling kommer provet inte att skickas och svaret ”Ej utförd” lämnas. Detta då 16S vanligen inte tillför ytterligare information vid positiv odling. Om analysen ändå önskas måste laboratoriet kontaktas inom en vecka.

Se informationskälla

Karolinska Universitetslaboratoriet, Karolinska Universitetssjukhuset 171 76 Stockholm Eller Klinisk mikrobiologi Akademiska sjukhuset Dag Hammarskjölds Väg 38 752 37 Uppsala

www.labhandbok.se/findny.asp?State=2&Analysid=2859 www.karolinska.se/.../

2026-09-08